Izo, en Ronin, og Raiden, en ork, arbeider for å bringe en ung alvejente og staven hun bærer til alvenes land i nord.

Han kom fra Afrika og kjempet sammen med en mektig føydalherre i det brutale Japan på 1500-tallet. De kalte ham den svarte samuraien, og han ble en legende.

Hvert 1000. år samles gudenes råd for å avgjøre menneskehetens skjebne. Etter 7 millioner år med menneskelig historie kommer gudene til den konklusjon at menneskene er uforbederlige og må utryddes.

En pensjonert gangster tilbringer tiden sin som husmann og utfører hjemmeoppgaver.

En menneskelig jente hemmelig oppdratt av roboter begynner å avdekke de mørke hemmelighetene bak hennes frodige, utopiske verden hvor menneskeheten nesten har forsvunnet.